本實用新型公開了一種生物多樣性樣本制取裝置，包括采樣箱，所述采樣箱套接在儲存箱中，所述儲存箱的底端設置有收縮機構，制面板會采集壓力感應器的數據控制測量水的深度，并控制分流器出水到儲存箱中三個不同的儲水槽中，而第一出水管則是排除不同深度水樣多余的水，進而達到收集不同深度樣本同時還能保證其準確性，通過第二撥板向下按壓抵柱遠離限位板在順時針旋轉連接軸至九十度，同時第一撥板向外撥動第一撥板，第一彈簧發生形變且卡柱遠離旋轉柱上的孔洞，套柱往遠離儲存箱方向移動，移動至旋轉柱最底端端的孔洞時在松開撥動第一撥板，第一彈簧在恢復形變的作用下卡柱卡在旋轉柱上的孔洞中，進而增加高度和便捷性。